它主要是由第一层过滤的滤材负责，最常见的就是过滤棉。
过滤棉可以将水中的杂质滤除。
需要注意的是，为了保证滤棉的效果，定期要清理一下，清理的时候不能用新水，必须要用原缸水才行。
2、化学过滤：化学过滤的作用是吸附水中的离子，常用的有活性炭、吸氨石等等，它们都可以放在鱼缸中，从而起到过滤的效果，但由于吸附有一定的上限，所以每隔三个月左右就要更换一批，不然就起不到效果了。
3、生物过滤：生物过滤主要是培养硝化细菌。
硝化细菌可以在开缸的时候倒入，每周加一点，同时还要关灯爆氧，这样它才能更快的生长繁殖，从而建立良好的硝化系统。
硝化细菌可以转化氨氮，从而改善水体环境。
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底过滤鱼缸粪便怎么解决底过滤鱼缸有粪便的话，可以在换水的时候清理，也可以让它自然分解。换水清理的话，需要准备一根管子，将其通到鱼缸底部，另一头则要放在更低的地方，然后轻嘬一口，水就会从缸底被抽出来了，同时还会带着鱼缸里的脏东西。如果要自然分解，则需要鱼缸有较强的硝化系统，能够在分解后不会让水质恶化。